首先，我阐述一下众所周知的概念，MVC指Model、View和Controler，三层指UI层（或View层）、BL层和DA层。
共同点：两者都有三个要素，都有一个View，而且在常见的三层中也另有一个Model类库。
不同点：三层是架构，MVC是开发模式。这么说可能大家依然不明白，还是打个比方吧，就像盖房子，要先确定盖几层，这就是架构，而每一层究竟是使用单跨梁还是多跨梁，这就是模式。
架构是基础性的，领统性的，确定后不可以随便修改，否则就像三层的地基上盖四层，很容易出问题；
模式是指导性的，可在实施过程中根据实际情况做可控调整，比如原计划每一层都用多跨梁，实施时发现第三层用单跨梁也能够满足需求，经报批同意后， 完全可以按照新方案进行。
由于ASP.NET的MVC例子将整个解决方案都是用MVC来实现，导致一些人认为项目要么使用MVC，要么使用N层，其实，二者不应该那么对立，因为这样做，导致MVC的Model太过庞大不易管理，我们完全可以在MVC中把Model进行细分，比如分成UI逻辑层（负责数据验证和键盘鼠标的输入输出管理）、业务逻辑层（负责业务数据的组织和加工）、数据持久层。反过来说，我们完全可以把三层的UI层和BL层按照MVC模式来实现。
注：以上看法是本人的一家之言，目的是欢迎大家讨论和指正，诚表谢意！
